バイオインフォマティクス研究のマネージャー・研究員

仕事概要    
我々はパートナーである大手企業との共同研究や自社研究において様々な大規模ゲノム改変細胞を作製しておりますが、ゲノム編集技術の正確性を検証する目的や細胞の表現型を解析する上で次世代シークエンサー（NGS）解析が重要な技術です。弊社が行っている様々なNGS解析を中心としてバイオインフォマティクス業務をご担当いただきます。 

・Quality evaluation of genome-edited cells using Whole Genome Sequence analysis (analysis of fastq.gz read data).
・RNA-seq analysis, pathway analysis, scRNA-seq analysis, ATAC-seq analysis, and Perturb-seq analysis targeting human cells.
・Optimization of genome design using machine learning, deep learning, and large language models.
・Building and fine-tuning a transformer-based biological foundation model.
・Utilization and management of AWS cloud servers.
・Utilization of lab automation (automated cell culture system).

■想定される業務内容
・Whole Genome Sequence解析によるゲノム編集細胞の品質検査（fastq.gzリードデータの解析）
・ヒト細胞を対象としたRNA-seq解析/パスウェイ解析/scRNA-seq解析/ATAC-seq解析/Perturb-seq解析
・機械学習・深層学習・大規模言語モデルによるゲノムデザインの最適化
・トランスフォーマーベースの生物基盤モデルの構築やファインチューニング
・AWSクラウドサーバーの利用・運用
・ラボオートメーション（自動細胞培養装置）の活用

＜企業詳細＞
会社概要：Logomixは、「Maximize the potential of cells by our genome engineering」をミッションに掲げ、ヒト幹細胞など様々な生物種の細胞機能を効率よく設計・改変する細胞エンジニアリング企業です。ノーベル賞を受賞したCRISPR（クリスパー）など従来の技術は細胞の設計図であるゲノムが持つ機能情報の「一部のみを編集」するのに対し、Logomixの大規模ゲノム改変技術Geno-Writing™はゲノム全体を「大規模に再構築」することで、ゲノムの機能情報を根本から組み替えます。これにより新たな機能を細胞に付与し、細胞治療・再生医療の開発に従事しています。Logomixは半導体産業におけるArm社のように「産業の基盤」となることを目指し、細胞機能エンジニアリング企業として、細胞の機能を飛躍的に向上させ、これまで不可能だった画期的な製品開発を実現します。